大约有20%药物流产的患者，流产后出血时间较长，最长可达1-2个月，少数人可能流产不全仍需手术清宫，而且增加感染机会，其他不良反应还有一过性的下腹痛、恶心、腹泻等。人工流产手术是经过手术器械将胎囊、蜕膜从宫腔中“吸出”，从而结束妊娠。由于手术器械在操纵时有一个从宫颈进入宫腔的过程，因此有可能将宫颈管内的细菌带入宫腔，引起盆腔炎症。

　　药物流产后卵巢一般可在22天内恢复排卵功能，1个月左右月经来潮。但有少数妇女在药流后出现经期延长、周期是非不一、闭经等月经失调现象。这种情况一般在2～3个月后恢复正常，少数人持续时间较长。

　　根据临床上统计，药流成功率只有75%左右，也就是说会有25%的女性面临着药流不全或者药流失败的危急。一旦流产失败还得面临刮宫的第二次风险，因此一般正规都不建议患者使用药流。